Как и в строении скелета, так и во внутреннем строении морфология птиц полностью подчинена полету.
Кровеносная система
Птицы, как и млекопитающие, — теплокровные животные, что делает их независимыми от температуры среды и способствует широкому расселению, даже в весьма негостеприимных холодных краях. Средняя температура тела у птиц около 41С, что выше, чем у большинства млекопитающих. Сердце у птиц, как и у млекопитающих, четырехкамерное. Полностью разделен большой и малый круг кровообращения. В отличие от зверей у птиц сохраняется только правая дуга аорты. Эритроциты у птиц мелкие, овальные. Они имеют ядра. Этими признаками кровь птиц отличается от крови млекопитающих. Напомним, что у зверей эритроциты относительно крупные и безъядерные, имеющие округлую двояковогнутую форму.
Дыхательная система
Дыхательная система птиц крайне своеобразна. Через ноздри и их внутренние отверстия (хоаны) воздух попадает в ротовую полость, затем через гортанную щель, ограниченную хрящами, он направляется в трахею. В отличие от млекопитающих, верхняя гортань не имеет голосовых связок. С ее помощью звуки могут издавать только некоторые виды птиц, например, гуси, которые шипят, изменяя просвет гортанной щели. Трахея у птиц очень длинная. Она используется как резонатор звуков. У многих видов птиц трахея значительно длиннее шеи. Она может образовывать петлю, которая располагается на шее, под кожей грудины или даже на киле. Нижний участок трахеи и начальные участки бронхов образуют нижнюю гортань. Расположенные там мембраны, складки слизистой оболочки, снабженные специальной мускулатурой, а также окостеневшие нижние кольца трахей (у уток и котинг) обеспечивают все многообразие звуков, которые издают птицы. Сами звуковые колебания возникают при прохождении тока воздуха через всю эту сложную систему.
Легкие
Легкие птиц относительно невелики по объему. Они имеют губчатое, а не альвеолярное, как у млекопитающих, строение. С легкими соединены воздушные мешки, заполняющиеся воздухом и прокачивающие его через легкие. Вследствие такого строения для птиц характерно дыхание, называемое четырехтактным. Суть его заключается в том, что обогащение крови кислородом происходит как во время вдоха, так и во время выдоха. Это обеспечивает высокий уровень метаболизма, что необходимо для такого энергоемкого процесса, каким является полёт.
Пищеварительная система
Пищеварительная система птиц также обеспечивает высокий уровень обмена веществ. Птицы лишены зубов, поэтому измельчение пищи в ротовой полости невозможно. Длинный растяжимый пищевод позволяет заглатывать крупные куски пищи. У части птиц (куриных, дневных хищников, голубей, попугаев) выражено расширение пищевода, называемое зобом. Зоб служит временным вместилищем пищи. У тетеревиных и некоторых других видов в зобу находятся гастролиты – камешки, которые способствуют перемалыванию грубой пищи. Эти камешки птицы отыскивают и заглатывают. Желудок птиц разделен на два отдела: железистый и мускульный. Железистый желудок выделяет пищеварительные ферменты, а мускульный отвечает за перетирание пищи. У птиц, питающихся грубыми растительными кормами, стенки мускульного желудка выстланы рогоподобной кутикулой, что улучшает качество перетирания пищи. Таким образом, у птиц «зубы» располагаются не в ротовой полости, а в желудке. Там и происходит не только переваривание пищи, но и ее механическая обработка. Кишечник у птиц очень длинный, что позволяет увеличить поверхность всасывания. Длина кишечника может в 12 раз превосходить длину птицы. Короткая прямая кишка у птиц, как и у пресмыкающихся, открывается в клоаку. Печень у птиц крупная, что позволяет им накапливать значительные энергетические запасы углеводов (гликогена).
Выделительная система
Выделительная система птиц состоит из двух тазовых почек. Мочевого пузыря у птиц нет, а мочеточники открываются прямо в клоаку. У некоторых видов морских и пустынных птиц имеется добавочные органы солевого обмена – надорбитальные железы. Они выделяют избыток солей, которые выходят наружу в виде капелек секрета, стекающих из ноздрей.
Нервная система
Нервная система и уровень высшей нервной деятельности у птиц ближе к млекопитающим, чем к рептилиям. Головной мозг у птиц довольно крупный. Особенно велики размеры переднего мозга и мозжечка. Основную массу полушарий переднего мозга составляют разросшиеся полосатые тела, а кора больших полушарий развита слабо. Заметному усложнению подвергаются органы зрения. Зрение и слух – два основных органа чувств у птиц. Глаза крупные. Их строение значительно более сложное, чем у млекопитающих. Двойная аккомодация, высокая плотность фоторецепторов (палочек и колбочек), наличие двух областей острого зрения, большое общее поле зрения (у вальдшнепа составляет 360о), цветное и ультрафиолетовое зрение обеспечивают птицам возможность превосходно видеть в разных экологических условиях. Таким образом, по способности воспринимать зрительную информацию птицы превосходят все группы наземных позвоночных животных. Органы слуха напоминают по своему строению органы слуха пресмыкающихся, но многочисленные мелкие преобразования резко повышают общую чувствительность слуха и его роль в жизни птиц. Птицы хорошо слышат в диапазоне от 30 Гц до 30кГц. Прекрасно развитый слух в сочетании со сложной системой издаваемых звуков обеспечивает различные аспекты внутривидовой и межвидовой коммуникации у птиц. Обоняние у ряда видов птиц также довольно хорошо развито. Птицы могут находить многие корма по запаху, но в целом запахи играют в жизни птиц неизмеримо меньшую роль, чем в жизни млекопитающих.
Половая система
Оплодотворение внутреннее. Половые протоки открываются в клоаку. Самки откладывают крупные яйца, которые в яйцеводе покрываются оболочками. Наружная оболочка представляет собой известковую скорлупу.
